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Rogers(1994)和Yang等(1997b)已经对来自于化石或者陈旧材料中DNA
的提取技术作了综述。尽管他们的结论来自于动物的软组织或者硬组织材
料,但Yang等(1997b)的大体结论也适用于植物材料,即没有一种提取方法
总是最好的。一般地讲,一种以树脂为基质的提取方法,DNA吸附在硅胶上
,而蛋白类、脂类、多糖类被洗掉,这样可以产生较干净的提取物,但产
率一般低于用去污剂/酶消化和乙醇沉淀的产率。另外,虽然沉淀法的产
率,特别是添加共沉淀时,DNA片段的长度范围大于用特定洗脱液和树脂所
产生的DNA的片段,DNA片段的大小也影响硅胶提取或乙醇沉淀的产率。因
此,本章将详细地描述我们经常使用的以去污剂为基质的沉淀提取方法,
对于其它的方法,作者可以参阅上面提到的文章或参考文献,我也向读者
建议去参考分子研究中心(Molecular ResearchCenter)的植物提取液和程
序(DNAzol ES),这种方法对从某些材料中提取DNA的效果比较好,该方法
用于从老鼠粪便植物材料中提取DNA时,部分(但不是全部)效果很好(Golen
berg&Nizon,未发表)。
全部工作区域在提取之前必须用0.5%的次氯酸钠溶液擦洗。化石材
料可以在0.5%的次氯酸钠溶液中蘸一下进行表面消毒,然后用蒸馏水彻
底浸洗。但是如果将要研究的是非细菌或真菌的特有基因,这种消毒并不
是绝对必须的。除去有机质后,然后将样本在提取缓冲液中研成粉末。最
好直接在一次性的小离心管内用一次性的塑料碾槌(杵)直接磨碎组织以降
低外源污染或交叉污染,这可以手工操作或者在研杵上连接一个钻孔机进
行研磨。当既不可能得到灭菌设备,并由于材料太硬又不可能用塑料研杵
研磨时,也可以用瓷制研钵和研杵,但必须按上述的方法用次氯酸钠溶液
和UV进行处理。提取液中包含2%CTAB,7.4MNaCI,20mMEDTA(pH 8.0),
100mMTrisHCI(pH 8.0),1%PVP(MW二40000),4mMDEDTCA和5mMascorbica
cid(Bickel&Golenberg,未发表)。 这是改进的Golenberg(1993)提取液
,其中加了两种抗氧化剂:DEDTCA和Ascorbicacid。最终提取液的体积为0
.7mI,样品在65℃温育至少]小时。然后10000g离心10分钟来沉淀固
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