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地质微生物学的分子生物学方法
除了地质微生物学研究的常规技术,分子生物学工具在研究地质微
生物的存在、催化活性及机制方面也越来越重要。现在,多种分子(DNA
,RNA,蛋白质和磷脂)技术已应用于特异地质微生物的原位检测,配合
同位素组分分析可识别目标分子,这些技术不仅能够鉴定地质微生物种
类,还有助于了解其代谢动力学。基因组序列及生物物理技术的整体快
速发展将极大地扩展我们对已分离微生物基因功能的了解,还将增加我
们对环境中不可培养微生物种类的认识。最后,利用基因组学,细胞生
物和生物化学技术对基因及其产物催化地质化学反应的研究也有助于对
地质微观变化机制的了解。同时,通过这些分子生物学工具的分析能够
预测将要发生的微生物活动并估测他们对环境的地质化学影响。
哪些微生物在起作用?地质微生物的鉴定
鉴定纯培养微生物的分子方法包括DNA/DNA杂交,DNA/RNA杂交,
DNA指纹和16S核糖体RNA(16S rRNA)分析。DNA指纹包括从未知生物的纯
培养中提取DNA,用特异限制酶降解DNA,将其切割成多核苷酸片段,消
化后电泳,并与同样方法处理的已知微生物纯培养DNA相应部分相比较
。因为有大量的地质微生物不可分离培养,所以不依赖培养的鉴定方法
就尤为重要。
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