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利用该方法从海洋沉淀物中纯化了厌氧共生的甲烷氧化菌株,随后
利用代谢基因组测序,PCR,显微法观察,发现这些捕捉的细菌没有预
期的多样性,但有新的功能性和与共生菌相关的代谢。磁电机一FISH方
法唯一的优势是它能够修复包含整个未培养目标生物的基因组。附加说
明是非目标微生物可能伴随着富集体被纯化出来。虽然单独的物理公式
不足以证明共生关系,但靠磁电机一FISH和代谢基因的鉴定推断可能的
共生关系是接下来探索的新领域
细胞代谢技术
到目前为止,我们已经讨论了应用荧光探针来鉴定生物多态性的单
细胞技术,并提供了同位素标记或基因组分析来推断功能的方法。大多
数荧光探针的应用能够被用于确定包括pH、膜通透性、酶活力、反应氧
气和氮组分、毒性和生存能力等的参数。分子探针生产商擅长生产荧光
反应物来检测活细胞的各种活动。
现今发展的另外一项技术为磁电机一FISH。磁电机一FISH将16SrRN
A靶向的FISH技术和一种即酪氨信号放大的扩增技术相结合(CARD—FISH
)(Pernthaler等,2002),利用带抗体的免疫荧光磁珠捕捉杂交细胞后
应用于CARD—FISH流程。从复杂环境样本中选择性捕捉靶生物,结合基
因组和代谢基因的PCR分析可以提供有关直接从环境中发现的未培养微
生物潜在的代谢信息。
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