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表型方法在确定各分类群之间有无相关性的过程中一直起着主要作
用。肠杆菌科早期的类群(属和种)最初是根据特有的表型特征或与它们
有关的重要疾病过程(如霍乱、伤寒和痢疾)而建立的。类群经常是以发
现者的名字命名,如摩根杆菌(摩根菌属)或志贺杆菌(痢疾志贺菌),以
分离地命名(如普罗威登斯菌,为普罗威登斯菌属),或与通常分离于肠
内容物的微生物表型部分相关的一组细菌命名,如副大肠杆菌。许多早
期的类群都仅仅以几个生化反应确定,但当另外的表型方法(如莫勒脱
羧酶一双水解酶试验)建立以后,类群就重新定义并且具有更好的特征
性。
随着计算机程序的出现和广泛应用,基于生化试验结果的分类学研
究在20世纪50年代末、60年代初提升到了一个新高度。基于数字分类学
,将具有大约85%或更高相似性(无加权成对分组方法分析)作为两个类
群属第2章肠杆菌科——分类学上的考虑 7于同一个种的基准,这些程
序可以对不同表型类群的相似性进行更快捷的分析口。今天,表型方法
除了传统的生化试验还利用了许多别的方法,这些方法包括菌落和显微
镜形态学、化学分类学(气液色谱)、碳利用方法、噬菌体分型、染料成
分抑制试验和血清学方法等,这里仅列举了少数几项口。
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