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随着科学的进步,分类系统亦随之被修正。
1969年怀特克(Whittaker)依据生物营养生活方式,
包括摄食作用、吸收作用及光合作用的差异,将所有生物分为五大界,
并广为世人所接受。五界系统包括有
动物界(Animalia):包括无脊椎动物及脊椎动物。
植物界(Plantae):藓苔植物、蕨类及种子植物等。
原生生物界(Protista):变形虫、草履虫、眼虫及阴道滴虫等原生动物,大部分藻类及黏菌等。
真菌界(Fungi):酵母菌、霉菌(如隐球菌、白色念珠状菌)及蕈类等丝状真菌。
原核生物界(Monera):细菌(如金黄色葡萄球菌、肺结核菌、霉浆菌等)及蓝绿藻
(blue-green algae;cyanobacteria)等不具有核膜及膜状胞器(如粒线体)的生物。
此五界系统分类不仅由单细胞到多细胞依其演化途径将生物加以归属,
更可见生物由原核细胞至真核细胞彼此相互依存的关系。
其中微生物被归纳在原生生物界、真菌界及原核生物界内。
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