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负染色电子显微镜法除了简单快速外,且当负染色诊断阳性时,即为确诊。例如当水泡液送诊时,很快即可因其病毒大小,形状,而能确诊为口蹄疫(picorna virus) 或丘疹性口炎(pox virus),如属同一类之病毒,例如picorna virus 之口蹄疫,猪水泡病及水泡病时,可借免疫负染色法而快速确诊。
引起下痢之冠状病毒,轮状病毒,腺病毒及星状病毒也可借负染色法而快速诊断,其他引起肠炎的肠道小病毒尤其是介于20~30 nm者,可利用免疫电子显微镜法确诊,如鸭肝炎病毒,小病毒(parvo virus),猫白血病病毒,皆可利用这种方法加以确诊。
利用薄切片技术可观察病毒于组织细胞内增生的情形,但因其操作繁杂,费时,很难应用于常规性的鉴定。因负染色时病毒颗粒之结构较为清楚明显,且操作简单快速,故一般病性鉴定皆以负染色法进行。
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