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免疫反应能力 (Immune response) 也已証明是可以遗传,遗传率在20%~40%之间,与动物抗病能力有很大的遗传相关。因此,选拔免疫反应遗传能力,间接地可增加动物的抗病能力,且免疫反应能力基因(Ir基因)又与MHC基因具有很紧密的相关性。鸡的抗马立克病毒症,是与鸡血型B基因座的B12基因有关;牛的淋巴球抗原 (BoLA) 的W12基因与牛对白血病病毒的易感性有关;在人类的HLA或老鼠H-2组织抗原的基因也都証明动物与疾病的抵抗性有关,所以免疫反应能力与MHC多态型都可用于抗病育种的间接选拔。
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